“党旗领航工程”是校党委自2007年9月创造性地提出并实施的一项重大学生党建活动，迄今已持续开展10余年。新时代下，学校党委也不断赋予了“党旗领航工程”新的含义。“新时代党旗领航工程”核心内涵为“党旗领航，责任以行”。以“让党旗高高飘扬”为目标，通过“早日站在党旗下、党旗在我心中、我为党旗添光彩”三个阶段，引导学生学思用贯通、知信行统一，立志做有理想、敢担当、能吃苦、肯奋斗的新时代好青年。

2010年1月22日，习近平同志视察华中科技大学，参加“我为党旗添光彩”特色党日活动指出，从活动中看到了80后、90后青年一代的精神风貌，看到了学校抓素质教育所取得的成绩，看到了学校党建工作的成果。